Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn1Q08091 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnn1Q08091 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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