Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelbQ04863 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelbQ04863 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelbQ04863 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RelbQ04863 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelbQ04863 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RelbQ04863 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RelbQ04863 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RelbQ04863 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RelbQ04863 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RelbQ04863 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms