Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emx2Q04744 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emx2Q04744 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Emx2Q04744 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Emx2Q04744 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms