Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgfr4Q03142 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgfr4Q03142 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgfr4Q03142 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgfr4Q03142 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgfr4Q03142 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgfr4Q03142 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgfr4Q03142 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fgfr4Q03142 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgfr4Q03142 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgfr4Q03142 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgfr4Q03142 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms