Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfiaQ02780 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NfiaQ02780 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NfiaQ02780 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NfiaQ02780 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms