Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gjb2Q00977 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gjb2Q00977 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb2Q00977 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms