Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Csf2raQ00941 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Csf2raQ00941 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csf2raQ00941 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csf2raQ00941 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csf2raQ00941 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Csf2raQ00941 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Csf2raQ00941 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Csf2raQ00941 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms