Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F8a1Q00558 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
F8a1Q00558 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F8a1Q00558 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F8a1Q00558 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms