Protein–RNA interactions for Protein: P97873

Loxl1, Lysyl oxidase homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl1P97873 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Loxl1P97873 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Loxl1P97873 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Loxl1P97873 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Loxl1P97873 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms