Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx1P81068 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx1P81068 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx1P81068 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx1P81068 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx1P81068 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx1P81068 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx1P81068 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx1P81068 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx1P81068 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx1P81068 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx1P81068 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx1P81068 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx1P81068 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx1P81068 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms