Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb6P70689 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb6P70689 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gjb6P70689 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb6P70689 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms