Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldb1P70662 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ldb1P70662 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ldb1P70662 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms