Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ext2P70428 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ext2P70428 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ext2P70428 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ext2P70428 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ext2P70428 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ext2P70428 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ext2P70428 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ext2P70428 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ext2P70428 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ext2P70428 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ext2P70428 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ext2P70428 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ext2P70428 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ext2P70428 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ext2P70428 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ext2P70428 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ext2P70428 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ext2P70428 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms