Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msx3P70354 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Msx3P70354 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msx3P70354 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msx3P70354 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msx3P70354 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msx3P70354 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msx3P70354 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msx3P70354 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msx3P70354 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msx3P70354 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msx3P70354 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Msx3P70354 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msx3P70354 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msx3P70354 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msx3P70354 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msx3P70354 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Msx3P70354 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms