Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtnP63089 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtnP63089 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtnP63089 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtnP63089 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtnP63089 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtnP63089 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtnP63089 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtnP63089 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtnP63089 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtnP63089 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtnP63089 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtnP63089 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PtnP63089 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtnP63089 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtnP63089 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtnP63089 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtnP63089 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtnP63089 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtnP63089 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtnP63089 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtnP63089 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtnP63089 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtnP63089 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtnP63089 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtnP63089 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtnP63089 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtnP63089 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtnP63089 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtnP63089 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtnP63089 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtnP63089 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtnP63089 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtnP63089 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtnP63089 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtnP63089 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtnP63089 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtnP63089 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtnP63089 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtnP63089 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtnP63089 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtnP63089 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtnP63089 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtnP63089 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtnP63089 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtnP63089 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtnP63089 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtnP63089 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PtnP63089 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtnP63089 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtnP63089 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtnP63089 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtnP63089 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtnP63089 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtnP63089 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtnP63089 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtnP63089 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtnP63089 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtnP63089 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtnP63089 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtnP63089 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtnP63089 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtnP63089 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtnP63089 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtnP63089 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtnP63089 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtnP63089 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtnP63089 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtnP63089 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtnP63089 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtnP63089 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtnP63089 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtnP63089 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtnP63089 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtnP63089 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtnP63089 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtnP63089 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtnP63089 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtnP63089 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtnP63089 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PtnP63089 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtnP63089 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtnP63089 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtnP63089 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtnP63089 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtnP63089 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtnP63089 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtnP63089 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PtnP63089 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtnP63089 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtnP63089 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtnP63089 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtnP63089 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtnP63089 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtnP63089 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtnP63089 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtnP63089 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtnP63089 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtnP63089 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtnP63089 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms