Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vsnl1P62761 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vsnl1P62761 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsnl1P62761 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vsnl1P62761 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vsnl1P62761 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vsnl1P62761 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vsnl1P62761 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vsnl1P62761 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vsnl1P62761 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vsnl1P62761 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vsnl1P62761 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vsnl1P62761 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vsnl1P62761 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms