Protein–RNA interactions for Protein: P61294

Rab6b, Ras-related protein Rab-6B, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6bP61294 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab6bP61294 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab6bP61294 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab6bP61294 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab6bP61294 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab6bP61294 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab6bP61294 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab6bP61294 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab6bP61294 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rab6bP61294 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab6bP61294 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab6bP61294 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab6bP61294 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab6bP61294 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms