Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tpm1P58771 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm1P58771 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm1P58771 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm1P58771 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm1P58771 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm1P58771 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm1P58771 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm1P58771 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm1P58771 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm1P58771 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm1P58771 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm1P58771 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms