Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Strn4P58404 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Strn4P58404 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Strn4P58404 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Strn4P58404 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Strn4P58404 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Strn4P58404 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Strn4P58404 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Strn4P58404 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Strn4P58404 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Strn4P58404 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Strn4P58404 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Strn4P58404 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms