Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rce1P57791 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rce1P57791 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rce1P57791 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rce1P57791 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rce1P57791 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rce1P57791 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rce1P57791 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rce1P57791 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rce1P57791 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rce1P57791 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rce1P57791 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rce1P57791 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms