Protein–RNA interactions for Protein: P56842

Tcl1b3, Protein TCL1B3, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcl1b3P56842 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcl1b3P56842 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcl1b3P56842 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcl1b3P56842 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcl1b3P56842 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms