Protein–RNA interactions for Protein: P56392

Cox7a1, Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7a1P56392 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox7a1P56392 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox7a1P56392 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms