Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab4aP56371 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab4aP56371 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4aP56371 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab4aP56371 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms