Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rrp1P56183 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp1P56183 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rrp1P56183 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.6 ms