Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn5P54830 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn5P54830 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn5P54830 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn5P54830 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn5P54830 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn5P54830 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn5P54830 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpn5P54830 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms