Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lbx1P52955 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lbx1P52955 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lbx1P52955 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms