Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efnb1P52795 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efnb1P52795 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efnb1P52795 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms