Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa10P50708 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Defa10P50708 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa10P50708 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa10P50708 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa10P50708 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa10P50708 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa10P50708 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa10P50708 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa10P50708 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa10P50708 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms