Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa8P50706 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa8P50706 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa8P50706 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa8P50706 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa8P50706 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Defa8P50706 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa8P50706 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa8P50706 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa8P50706 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa8P50706 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa8P50706 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa8P50706 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa8P50706 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa8P50706 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms