Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg3P47867 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg3P47867 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg3P47867 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg3P47867 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg3P47867 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scg3P47867 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg3P47867 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg3P47867 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg3P47867 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scg3P47867 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms