Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rab11bP46638 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11bP46638 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rab11bP46638 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rab11bP46638 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms