Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ItgavP43406 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ItgavP43406 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ItgavP43406 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgavP43406 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgavP43406 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ItgavP43406 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ItgavP43406 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ItgavP43406 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ItgavP43406 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ItgavP43406 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ItgavP43406 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgavP43406 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgavP43406 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms