Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf5P43027 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf5P43027 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gdf5P43027 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf5P43027 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms