Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf3rP40223 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf3rP40223 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf3rP40223 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf3rP40223 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf3rP40223 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf3rP40223 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf3rP40223 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf3rP40223 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Csf3rP40223 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csf3rP40223 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms