Protein–RNA interactions for Protein: P38649

Abo, Histo-blood group ABO system transferase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AboP38649 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AboP38649 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AboP38649 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AboP38649 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AboP38649 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AboP38649 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AboP38649 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AboP38649 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AboP38649 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AboP38649 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AboP38649 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AboP38649 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AboP38649 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AboP38649 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AboP38649 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AboP38649 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AboP38649 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AboP38649 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AboP38649 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AboP38649 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AboP38649 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AboP38649 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AboP38649 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AboP38649 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AboP38649 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AboP38649 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AboP38649 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AboP38649 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AboP38649 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AboP38649 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AboP38649 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AboP38649 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AboP38649 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AboP38649 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AboP38649 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AboP38649 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AboP38649 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AboP38649 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AboP38649 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AboP38649 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AboP38649 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AboP38649 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AboP38649 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AboP38649 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AboP38649 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AboP38649 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AboP38649 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AboP38649 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AboP38649 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AboP38649 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AboP38649 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AboP38649 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AboP38649 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AboP38649 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AboP38649 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AboP38649 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AboP38649 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AboP38649 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AboP38649 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AboP38649 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AboP38649 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AboP38649 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AboP38649 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AboP38649 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AboP38649 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AboP38649 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AboP38649 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AboP38649 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AboP38649 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AboP38649 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AboP38649 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AboP38649 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AboP38649 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AboP38649 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AboP38649 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AboP38649 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AboP38649 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AboP38649 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AboP38649 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AboP38649 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AboP38649 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AboP38649 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AboP38649 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AboP38649 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AboP38649 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AboP38649 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AboP38649 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AboP38649 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AboP38649 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AboP38649 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AboP38649 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AboP38649 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AboP38649 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AboP38649 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AboP38649 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AboP38649 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AboP38649 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AboP38649 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AboP38649 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AboP38649 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms