Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Grin2aP35436 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Grin2aP35436 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Grin2aP35436 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Grin2aP35436 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Grin2aP35436 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Grin2aP35436 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Grin2aP35436 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Grin2aP35436 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Grin2aP35436 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms