Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TpoP35419 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TpoP35419 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TpoP35419 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TpoP35419 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TpoP35419 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TpoP35419 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TpoP35419 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TpoP35419 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TpoP35419 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TpoP35419 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
TpoP35419 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TpoP35419 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TpoP35419 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TpoP35419 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TpoP35419 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TpoP35419 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TpoP35419 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TpoP35419 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TpoP35419 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TpoP35419 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TpoP35419 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TpoP35419 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TpoP35419 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TpoP35419 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TpoP35419 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TpoP35419 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TpoP35419 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TpoP35419 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TpoP35419 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TpoP35419 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TpoP35419 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TpoP35419 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TpoP35419 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TpoP35419 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TpoP35419 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TpoP35419 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TpoP35419 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TpoP35419 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TpoP35419 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TpoP35419 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TpoP35419 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TpoP35419 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TpoP35419 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TpoP35419 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TpoP35419 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TpoP35419 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TpoP35419 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TpoP35419 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TpoP35419 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TpoP35419 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TpoP35419 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms