Protein–RNA interactions for Protein: P35294

Rab19, Ras-related protein Rab-19, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab19P35294 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab19P35294 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab19P35294 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab19P35294 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab19P35294 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab19P35294 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab19P35294 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab19P35294 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab19P35294 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab19P35294 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab19P35294 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms