Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.38e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.88e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 HNRNPA1-214ENST00000551803 372 ntTSL 36.6□□□□□ -1.352e-42■■■■■ 51.9
GTF2F1P35269 MICAL2-223ENST00000531732 1089 ntTSL 222.66■■□□□ 1.221e-8■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 MICAL2-218ENST00000528931 2868 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 AL591895.1-201ENST00000424332 348 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.461e-13■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 MICAL2-207ENST00000525119 566 ntTSL 410.89□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 MICAL2-204ENST00000524685 573 ntTSL 310.89□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 MICAL2-231ENST00000537344 3774 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 MICAL2-217ENST00000527546 3358 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.71e-8■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 MICAL2-225ENST00000532179 589 ntTSL 39.85□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 MICAL2-229ENST00000533389 593 ntTSL 49.23□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 51.8
GTF2F1P35269 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.099e-8■■■■■ 51.7
GTF2F1P35269 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.169e-8■■■■■ 51.7
GTF2F1P35269 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.319e-8■■■■■ 51.7
GTF2F1P35269 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.389e-8■■■■■ 51.7
GTF2F1P35269 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.057e-8■■■■■ 51.6
GTF2F1P35269 SMG7-210ENST00000502375 566 ntTSL 516.1■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.851e-6■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.954e-10■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.624e-10■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.964e-10■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 C21orf2-204ENST00000462742 4532 ntTSL 220.4■□□□□ 0.864e-10■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.767e-7■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 222.94■■□□□ 1.267e-7■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.167e-7■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.157e-7■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 520■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 519.82■□□□□ 0.767e-7■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.497e-7■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.57e-7■■■■■ 51.5
GTF2F1P35269 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.136e-7■■■■■ 51.3
GTF2F1P35269 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 51.3
GTF2F1P35269 MAP4K4-211ENST00000427603 526 ntTSL 410.61□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 51.3
GTF2F1P35269 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 51.3
GTF2F1P35269 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 51.3
GTF2F1P35269 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.614e-8■■■■■ 51.3
GTF2F1P35269 POLR2H-201ENST00000412877 836 ntTSL 224.22■■□□□ 1.474e-8■■■■■ 51.3
GTF2F1P35269 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.414e-8■■■■■ 51.3
GTF2F1P35269 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 222.14■■□□□ 1.131e-8■■■■■ 51.2
GTF2F1P35269 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 51.2
GTF2F1P35269 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)23.55■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 51.2
GTF2F1P35269 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)23.55■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 51.2
GTF2F1P35269 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)22.45■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 51.2
GTF2F1P35269 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 51.2
GTF2F1P35269 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 51.2
GTF2F1P35269 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.753e-8■■■■■ 50.8
GTF2F1P35269 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.323e-8■■■■■ 50.8
GTF2F1P35269 SDCCAG8-202ENST00000435549 1551 ntTSL 1 (best)14.84□□□□□ -0.036e-9■■■■■ 50.7
GTF2F1P35269 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.076e-9■■■■■ 50.7
GTF2F1P35269 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.13e-11■■■■■ 50.6
GTF2F1P35269 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.033e-11■■■■■ 50.6
GTF2F1P35269 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.873e-11■■■■■ 50.6
GTF2F1P35269 MAPK8IP3-204ENST00000561949 489 ntTSL 220.39■□□□□ 0.853e-11■■■■■ 50.6
GTF2F1P35269 MAPK8IP3-210ENST00000566589 873 ntTSL 517.74■□□□□ 0.433e-11■■■■■ 50.6
GTF2F1P35269 SRP14-AS1-201ENST00000504245 2317 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.41e-10■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.041e-10■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 C16orf95-203ENST00000564821 487 ntTSL 39.89□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 WDR45B-203ENST00000571817 889 ntTSL 322.57■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 WDR45B-208ENST00000574828 765 ntTSL 317.74■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 WDR45B-206ENST00000573616 896 ntTSL 516.39■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 WDR45B-205ENST00000572583 2322 ntTSL 1 (best)15.9■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 WDR45B-204ENST00000571835 869 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 50.5
GTF2F1P35269 PRKD2-207ENST00000597088 855 ntTSL 226.38■■□□□ 1.812e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.482e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 ABHD5-207ENST00000486764 618 ntTSL 222.85■■□□□ 1.252e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 ABHD5-203ENST00000454293 464 ntTSL 322.8■■□□□ 1.242e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.142e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 AMPD2-222ENST00000531203 575 ntTSL 419.85■□□□□ 0.772e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 ABHD5-201ENST00000013894 833 ntTSL 319.66■□□□□ 0.742e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 AMPD2-212ENST00000486282 582 ntTSL 419.48■□□□□ 0.712e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 AMPD2-216ENST00000527846 585 ntTSL 419.27■□□□□ 0.682e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 AMPD2-217ENST00000528270 588 ntTSL 417.53■□□□□ 0.42e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 AMPD2-223ENST00000531734 572 ntTSL 417.48■□□□□ 0.392e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 PRKD2-210ENST00000597641 456 ntTSL 417.41■□□□□ 0.382e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 AMPD2-209ENST00000474459 814 ntTSL 417.27■□□□□ 0.362e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 AMPD2-215ENST00000526301 2354 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.352e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 ABHD5-204ENST00000456453 876 ntTSL 415.28■□□□□ 0.042e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 PRKD2-205ENST00000595132 624 ntTSL 515.23■□□□□ 0.032e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 PRKD2-211ENST00000598633 541 ntTSL 513.7□□□□□ -0.222e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 PRKD2-215ENST00000601605 536 ntTSL 513.62□□□□□ -0.232e-12■■■■■ 50.3
GTF2F1P35269 C21orf58-208ENST00000472607 713 ntTSL 316.04■□□□□ 0.163e-24■■■■■ 50.2
GTF2F1P35269 DLG4-208ENST00000489885 1894 ntTSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.477e-7■■■■■ 50.2
GTF2F1P35269 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.129e-9■■■■■ 50.1
GTF2F1P35269 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.119e-9■■■■■ 50.1
GTF2F1P35269 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)21.69■■□□□ 1.069e-9■■■■■ 50.1
GTF2F1P35269 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-12■■■■■ 50
GTF2F1P35269 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-12■■■■■ 50
GTF2F1P35269 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 313.83□□□□□ -0.22e-12■■■■■ 50
GTF2F1P35269 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.835e-11■■■■■ 49.9
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 77.3 ms