Protein–RNA interactions for Protein: P31996

Cd68, Macrosialin, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd68P31996 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd68P31996 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd68P31996 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd68P31996 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd68P31996 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd68P31996 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd68P31996 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd68P31996 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd68P31996 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd68P31996 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd68P31996 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd68P31996 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd68P31996 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd68P31996 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd68P31996 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd68P31996 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd68P31996 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cd68P31996 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd68P31996 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd68P31996 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd68P31996 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd68P31996 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd68P31996 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms