Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DesP31001 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DesP31001 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DesP31001 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DesP31001 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DesP31001 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DesP31001 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DesP31001 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DesP31001 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DesP31001 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DesP31001 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DesP31001 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DesP31001 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DesP31001 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DesP31001 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DesP31001 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DesP31001 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DesP31001 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DesP31001 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DesP31001 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DesP31001 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DesP31001 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DesP31001 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DesP31001 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DesP31001 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DesP31001 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DesP31001 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DesP31001 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DesP31001 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DesP31001 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DesP31001 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DesP31001 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DesP31001 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DesP31001 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DesP31001 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DesP31001 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DesP31001 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DesP31001 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DesP31001 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DesP31001 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DesP31001 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DesP31001 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DesP31001 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DesP31001 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DesP31001 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DesP31001 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DesP31001 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DesP31001 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DesP31001 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DesP31001 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DesP31001 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DesP31001 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DesP31001 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DesP31001 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DesP31001 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DesP31001 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DesP31001 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DesP31001 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DesP31001 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DesP31001 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DesP31001 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DesP31001 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DesP31001 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DesP31001 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DesP31001 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DesP31001 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DesP31001 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DesP31001 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DesP31001 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DesP31001 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DesP31001 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DesP31001 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DesP31001 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DesP31001 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DesP31001 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DesP31001 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DesP31001 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DesP31001 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DesP31001 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DesP31001 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DesP31001 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DesP31001 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DesP31001 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DesP31001 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DesP31001 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DesP31001 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DesP31001 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DesP31001 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DesP31001 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DesP31001 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DesP31001 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DesP31001 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DesP31001 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DesP31001 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DesP31001 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DesP31001 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DesP31001 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DesP31001 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DesP31001 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DesP31001 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms