Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mmp3P28862 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mmp3P28862 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp3P28862 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp3P28862 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp3P28862 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp3P28862 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp3P28862 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp3P28862 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp3P28862 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp3P28862 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp3P28862 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp3P28862 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp3P28862 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms