Protein–RNA interactions for Protein: P28334

Htr1b, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1bP28334 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Htr1bP28334 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htr1bP28334 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms