Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2af2P26369 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2af2P26369 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
U2af2P26369 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2af2P26369 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af2P26369 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af2P26369 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af2P26369 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af2P26369 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af2P26369 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af2P26369 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af2P26369 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af2P26369 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af2P26369 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2af2P26369 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
U2af2P26369 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af2P26369 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af2P26369 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms