Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou2f1P25425 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou2f1P25425 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou2f1P25425 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou2f1P25425 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms