Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf239P24399 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf239P24399 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf239P24399 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf239P24399 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf239P24399 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf239P24399 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf239P24399 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf239P24399 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf239P24399 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf239P24399 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf239P24399 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms