Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnc2P20801 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnc2P20801 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnc2P20801 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnnc2P20801 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnc2P20801 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnc2P20801 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnc2P20801 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnc2P20801 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnc2P20801 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnc2P20801 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnc2P20801 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnc2P20801 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnc2P20801 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnc2P20801 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms