Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifrd1P19182 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifrd1P19182 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifrd1P19182 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifrd1P19182 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms