Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myf6P15375 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myf6P15375 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf6P15375 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf6P15375 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myf6P15375 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myf6P15375 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myf6P15375 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myf6P15375 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myf6P15375 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myf6P15375 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Myf6P15375 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myf6P15375 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myf6P15375 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myf6P15375 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Myf6P15375 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Myf6P15375 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Myf6P15375 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Myf6P15375 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myf6P15375 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myf6P15375 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myf6P15375 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myf6P15375 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myf6P15375 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Myf6P15375 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myf6P15375 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myf6P15375 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myf6P15375 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myf6P15375 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myf6P15375 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myf6P15375 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myf6P15375 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myf6P15375 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myf6P15375 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myf6P15375 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myf6P15375 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myf6P15375 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Myf6P15375 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myf6P15375 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myf6P15375 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Myf6P15375 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myf6P15375 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myf6P15375 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myf6P15375 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Myf6P15375 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myf6P15375 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myf6P15375 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myf6P15375 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myf6P15375 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myf6P15375 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Myf6P15375 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms