Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrphP15331 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrphP15331 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrphP15331 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PrphP15331 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrphP15331 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrphP15331 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrphP15331 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrphP15331 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrphP15331 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrphP15331 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrphP15331 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrphP15331 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrphP15331 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrphP15331 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrphP15331 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrphP15331 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrphP15331 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrphP15331 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrphP15331 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrphP15331 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PrphP15331 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrphP15331 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrphP15331 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrphP15331 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrphP15331 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrphP15331 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrphP15331 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrphP15331 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrphP15331 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrphP15331 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrphP15331 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrphP15331 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrphP15331 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrphP15331 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrphP15331 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrphP15331 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrphP15331 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrphP15331 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrphP15331 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PrphP15331 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrphP15331 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrphP15331 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PrphP15331 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrphP15331 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrphP15331 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrphP15331 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrphP15331 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrphP15331 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrphP15331 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrphP15331 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrphP15331 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrphP15331 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PrphP15331 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrphP15331 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrphP15331 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrphP15331 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrphP15331 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrphP15331 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrphP15331 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrphP15331 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrphP15331 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrphP15331 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrphP15331 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrphP15331 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrphP15331 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrphP15331 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrphP15331 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PrphP15331 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrphP15331 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrphP15331 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrphP15331 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrphP15331 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrphP15331 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrphP15331 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrphP15331 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrphP15331 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrphP15331 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrphP15331 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrphP15331 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrphP15331 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrphP15331 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrphP15331 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PrphP15331 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrphP15331 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrphP15331 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrphP15331 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PrphP15331 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrphP15331 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrphP15331 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrphP15331 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrphP15331 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrphP15331 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrphP15331 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrphP15331 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrphP15331 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrphP15331 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrphP15331 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrphP15331 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrphP15331 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms